Når en medarbejder har valgt beskatning under den særlige skatteordning for et indkomstår, kan medarbejderen ikke senere vælge, at indkomsten i stedet skal beskattes som skattepligtig almindelig indkomst. Se KSL § 48 F, stk. 5, 2. pkt. Denne regel går forud for genoptagelsesreglerne i SFL §§ 26-27. Beskatning under ordningen anses for valgt, hvis medarbejderen ikke indgiver selvangivelse som almindelig skattepligtig senest på tidspunktet for rettidig indgivelse af selvangivelsen for det pågældende indkomstår.
Hvis en medarbejder har selvangivet en indkomst som skattepligtig almindelig indkomst og efterfølgende ønsker at anvende den særlige skatteordning, kan medarbejderen anmode om genoptagelse af skatteansættelsen i henhold til SFL § 26, stk. 2, inden 1. maj i det fjerde år efter indkomstårets udløb. Genoptagelse kan ske på baggrund af oplysninger af såvel faktisk som retlig karakter. Endvidere gælder, at en skatteansættelse kan genoptages, hvis der forelægges SKAT oplysninger, der kan begrunde en ændring, uanset at oplysningerne ikke er nye i objektiv forstand. Afgørende er således, at oplysningerne ikke har dannet grundlag for den afgørelse, der ønskes genoptaget, og at der på baggrund af de forelagte oplysninger er anledning til at ændre skatteansættelsen. Se "Processuelle regler på SKAT's område", afsnit G.1.1.1.