Virksomheden skal klart identificere, hvilken transaktion der testes ved databaseundersøgelsen. Identifikation og afgrænsning af den transaktion, der testes, kan foretages som led i virksomhedens beskrivelse af de kontrollerede transaktioner. Se BEK nr. 42 af 24. januar 2006, § 5. Hvis databaseundersøgelsen foretages, fordi SKAT har anmodet om det, kan virksomheden blot henvise til denne anmodning.

Virksomhedens valg af prisfastsættelsesmetode skal begrundes. Den valgte prisfastsættelsesmetode har betydning for, hvilke udsøgningskriterier der skal lægges til grund for databaseundersøgelsen og dermed hele udsøgningsprocessen og det armslængdeinterval, der gælder for de sammenlignelige virksomheder. Dette skyldes, at betydningen af sammenlignelighedsfaktorerne varierer efter den anvendte prisfastsættelsesmetode. Se afsnit C.D.11.2.2 om armlængdeprincippet i relation til sammenlignelighedsanalysen.

Ved anvendelse af kommercielle databaser vil metoder baseret på nettoavancen (den transaktionsbestemte nettoavancemetode) ofte være mere anvendelige end metoder baseret på bruttoavancen.