Vestre Landsret fastslog i 2009, at begreberne momsgodtgørelse og momsfradrag ikke kan anses for at være synonyme. En momsgodtgørelse efter xML § 45x, stk. 4, kunne derfor ikke sidestilles med et momsfradrag og dermed give adgang til godtgørelse af energiafgift og CO₂-afgift for en virksomhed, der drev momsfritaget virksomhed. Se SKM2009.466.VLR og kendelser fra Landsskatteretten i afgørelsesskemaet til afsnit E.A.4.6.1.8 om momsregistreret virksomhed.

Ved xLOV nr. 277 af 27/03 2012x "Lov om ændring af lønsumsafgiftsloven, momsloven, opkrævningsloven, lov om offentligt hasardspil i turneringsform og forskellige andre love" er godtgørelsesbestemmelserne xML § 45x, stk. 3 og 4, ophævet pr. 01/04 2012 og i stedet overført til momslovens kapitel 9 om fradrag. Se xML § 37x, stk. 7 og 8.

Samtidig blev der i xELAL § 11x, stk. 16 (nu stk. 15), xGASAL § 10x, stk. 2, xKULAL § 8x, stk. 2, og xMINAL § 11x, stk. 2, indsat bestemmelser om, at godtgørelse af de pågældende energiafgifter ikke omfatter aktiviteter nævnt i xML § 37x, stk. 7 og 8.

Loven er således med til at præcisere gældende ret om, at kun virksomheder med momspligtige aktiviteter kan opnå godtgørelse for energiafgifter i det omfang, som virksomhederne har fradragsret for moms på indkøbte energiprodukter og varme.