Rederier, som ønsker at anvende tonnageskatteordningen, skal opgøre tonnagebeskattet indkomst og almindeligt beskattet indkomst hver for sig.

Den del af et rederiselskabs indkomst, der ikke kan henføres til tonnagebeskatning, beskattes efter skattelovgivningens almindelige regler. For den del af indkomsten, der kan tonnagebeskattes, erstattes den almindelige indkomst af den beskatning, der fremgår af afsnit S.C.8.4.1.